1947-1948

Pour cette saison, les Stéphanois espèrent faire mieux que la saison précedente où ils avaient terminé 11èmes.Maître Perroudon va mieux et est donc apte à revenir diriger le club. Ignance Tax garde lui son poste d'entraîneur. Un bon recrutement permet aux verts de retrouver des éléments clé tels qu'Antoine Cuissard et de très bons joueurs comme Manuel Fernandez ou encore Victor Mathieu. En coupe Charles Simon les verts réalisent un assez bon parcours et vont jusqu'en 32èmes de finale là où ils se feront sortir par une bonne équipe de Lens. En championnat, ils réalisent une très bonne performance en finissant 4èmes avec 41pts.Ils infligeront notamment une humiliation à Lille en s'imposant 8-2. Le meilleur buteur sera Antoine Rodriguez qui inscrira 15 buts.Une assez bonne saison pour les verts qui continuent de montrer qu'ils ont leur place au mailleur niveau footballistique Français.

1948-1949

Cette saison est terne pour les Stéphanois, avec quelques arrivées et départs.La direction reste la même et le club cherche de la stabilité.Les verts font un bon parcours en Coupe Charles Simon et vont jusqu'aux 16èmes de finale là où ils se feront battre par Nîmes sur le score de 2 à 1. En championnat ils font une saison moyenne en terminant 8èmes avec 35 points.Ils subiront de lourdes défaites contre plusieurs clubs:

une défaite 6-0 face à Sochaux,une défaite 5-1 face à Toulouse, une défaite 5-0 face à Lille...

Ils réaliseront aussi une belle victoire face au futur Champion et meilleur club Français: Reims. Le meilleur buteur des Stéphanois sera René Alpsteg avec 19 réalisations. Deux joueurs Stéphanois (Antoine Cuissard et Guy Huguet) représenteront les couleurs tricolores même si aucun d'eux n'inscrira de but. Au niveau de l'affluence, elle variera énormément en allant de minimum 2108 supporters pour au maximum 18 464 supporters. La moyenne de supporters sera de 7937 supporters. Une saison assez mitigée mais satisfaisante pour les Stéphanois.