1941-1943
1941-1942
L'horreur de la guerre continue de sévir sur l'effectif et le staff de l'ASSE. Le ratio arrivées/ départs est très déséquilibré. C'est aussi le retour d'un des meilleurs élément de l'équipe: Ignance Tax. Huit équipes se rajoutent dans la poule des verts. L'entraîneur des verts (Emile Cabannes) abandonne son poste de joueur pour être totalement un entraîneur. Ces derniers sortiront pour le premier match disputé en Coupe Charles Simon face à Annecy. En championnat, les verts réalisent une saison mitigée avec 7 victoires, 2 nuls et 7 défaites. Ex-Aequo avec Alès troisièmes du championnat. Le meilleur buteur Stéphanois sera Jules Bigot avec 9 réalisations. La plus large victoire des Stéphanois sera de "seulement" 3-0 face à Nîmes tandis qu'ils s'inclineront 8 à 3 face à Marseille. Cette défaite marque en quelque sorte le début de la rivalité entre les deux clubs.
1942-1943
Pour cette saison, le championnat se découpe en 2 poules de 16 équipes. Les verts évoluent toujours dans la poule "zone libre". Le fait majeur de cette saison est la démission de Pierre Guichard exaspéré par les décisions sportives prises par le gouvernement de Vichy. Pierre Guichard est donc remplacé par Paul Laval. Il décide de faire le ménage avec 10 départs pour le même nombre d'arrivées. Les verts font un beau parcours en Coupe Charles Simon mais se font malheureusement sortir en quarts de finales par l'USA Perpignan.En championnat, les verts s'en sortent bien en terminant 5èmes sur 16 avec 31 points.Leur plus large victoire sera face à Annecy en gagnant 6-0.Leur meilleur buteur sera Antoine Rodriguez avec 22 réalisations.